隨著人們生活水平的提高，食品安全逐漸為政府和民眾所重視。在食品安全中，微生物污染造成的食源性疾病仍是世界食品安全中最突出的問題。 以下就是我國食品微生物檢驗檢測體系的完善。
加工食品過程中，病菌常常會隨原料的生產、成品的加工、包裝與制品貯運進入食品中，造成食品污染，影響消費者的飲食安全。因此食品微生物檢驗工作對評價食品衛生質量，保證消費者飲食衛生有著極為重要的作用，并且研究靈敏度更高、特異性更強、簡便快捷的食品安全檢測技術和方法，建立和完善食品安全微生物檢測技術和體系迫在眉睫。
食品微生物檢驗的特點
對食品中微生物的檢驗需要專門的儀器和技術設施，并由受過專門訓練的工作人員負責操作進行，正是特殊的工作環境，形成了食品微生物檢驗自身的特征。
(一)涉及微生物范圍廣、要求高
食品微生物檢驗的范圍相當廣泛，一般包括：第一，引起人畜食物中毒的微生物及其毒素，如沙門氏菌、小腸結腸炎耶爾森菌、黃曲霉菌、副溶血性弧菌、等十幾種之多的病菌;第二是經食物傳播的病原微生物，是人類疾病病原微生物、畜禽疫病的病原微生物、人獸共患傳染病病原微生物。這幾類微生物的種類更多，一般情況下就可達數百種之多;第三是食品工業微生物，如釀造、發酵工業用霉菌酵母等曲種。
除了微生物檢驗的范圍廣泛，并且在食品微生物檢驗過程中，采集樣品也極為重要。在采樣時應對食品的原料來源、加工方法、運輸、保藏條件及銷售中的各個環節等在調查的基礎上采集具有代表性的樣品，采樣過程，需追求無菌操作，采樣數量及方法與檢驗目的相適應，采樣現場的溫度、濕度及衛生狀況同時監控。